Curriculum VitaeÖzgeçmiş
Tuna Birgün
EducationEğitim
MSc — Molecular Biology-Genetics and Biotechnology (major: Biotechnology)
Istanbul Technical University, Faculty of Science and Letters
2024 – present
BSc — Bioengineering
Marmara University, Faculty of Engineering
2020 – 2024
Yüksek lisans — Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji (uzmanlık: Biyoteknoloji)
İstanbul Teknik Üniversitesi, Fen-Edebiyat Fakültesi
2024 – günümüz
Lisans — Biyomühendislik
Marmara Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi
2020 – 2024
Positions & experienceGörevler ve deneyim
Research Assistant
Istanbul Yeni Yüzyıl University, Faculty of Arts and Sciences, Department of Molecular Biology and Genetics
Nov 2024 – present (full-time)
Bioinformatics Analyst (intern)
AxanLab, Gebze Technical University, Gebze, Kocaeli
Single-cell and single-nucleus RNA-seq (sc/snRNA-seq) of Huntington's disease model organisms — analyzing, integrating, and investigating large datasets on high-performance computing (HPC) systems.
Jul – Sep 2024
Laboratory Assistant (intern)
Istanbul Yeni Yüzyıl University
Studied mycotoxin effects of fungi (especially Fusarium graminearum) on wheat and barley samples sourced worldwide; used quantitative PCR (qPCR) and RNA/DNA/protein isolation, and performed genetic modification of microorganisms.
Jun – Sep 2022
Araştırma Görevlisi
İstanbul Yeni Yüzyıl Üniversitesi, Fen-Edebiyat Fakültesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü
Kasım 2024 – günümüz (tam zamanlı)
Biyoinformatik Analisti (stajyer)
AxanLab, Gebze Teknik Üniversitesi, Gebze, Kocaeli
Huntington hastalığı model organizmalarının tek hücreli ve tek çekirdekli RNA-seq (sc/snRNA-seq) analizi — yüksek başarımlı hesaplama (HPC) sistemlerinde büyük veri kümelerini analiz etme, birleştirme ve inceleme.
Temmuz – Eylül 2024
Laboratuvar Asistanı (stajyer)
İstanbul Yeni Yüzyıl Üniversitesi
Dünya genelinden temin edilen buğday ve arpa örnekleri üzerinde mantarların (özellikle Fusarium graminearum) mikotoksin etkilerini inceledim; kantitatif PCR (qPCR) ve RNA/DNA/protein izolasyonu kullandım, mikroorganizmalarda genetik modifikasyon gerçekleştirdim.
Haziran – Eylül 2022
Research group membershipsAraştırma grubu üyelikleri
MayaLab (Yeast Research Laboratory)
Istanbul Technical University
2024 – present
Bioinformatics Research Group (BaysanLab)
Istanbul Technical University
2025 – present
MayaLab (Maya Araştırma Laboratuvarı)
İstanbul Teknik Üniversitesi
2024 – günümüz
Biyoinformatik Araştırma Grubu (BaysanLab)
İstanbul Teknik Üniversitesi
2025 – günümüz
Conference presentationsKonferans bildirileri
- 1. Birgün, T., Topaloğlu, A., Esen, Ö., Baysan, M., & Çakar, Z. P. (2026, May 11–13). Genomic analysis of multiple stress-resistant Saccharomyces cerevisiae strains obtained by inverse metabolic engineering [Full-text conference presentation]. The International Graduate Research Symposium (IGRS), İstanbul, Türkiye.
- 2. Orhan, B., Birgün, T., & Yörük, E. (2025, December 17–19). Biyokontrol ajanlarının etkisi altındaki Fusarium spp.'de transkriptomik incelemeler [Conference presentation, summary, p. 210]. 8th International Eurasian Conference on Biological and Chemical Sciences (EurasianBioChem 2025), Ankara, Türkiye.
- 3. Sönmez, E., Birgün, T., & Çimen, H. (2024, October 11–12). Cell-specific prediction of protein–protein interaction networks in Huntington's disease [Full-text conference presentation]. 6th TuPA International Proteomics Congress, Kocaeli, Türkiye.
CertificatesSertifikalar
Teaching the AI Fluency Framework
Anthropic
Jul 2026 · ID 7dmff7ihqdf7
Python for Genomic Data Science
Johns Hopkins University
Aug 2025 · ID KW3OM1N7RCHT
Introduction to Genomic Technologies
Johns Hopkins University
Jul 2025 · ID BUZK1ION7362
Teaching the AI Fluency Framework
Anthropic
Temmuz 2026 · No: 7dmff7ihqdf7
Python for Genomic Data Science
Johns Hopkins Üniversitesi
Ağustos 2025 · No: KW3OM1N7RCHT
Introduction to Genomic Technologies
Johns Hopkins Üniversitesi
Temmuz 2025 · No: BUZK1ION7362
LanguagesDiller
Turkish — native. English — C1 (Advanced).
Türkçe — ana dil. İngilizce — C1 (İleri).
VolunteeringGönüllü çalışmalar
Volunteer — Foundation for the Support of Women's Work (Kadın Emeğini Değerlendirme Vakfı, KEDV)
Civil rights and social action.
May 2025 – present
Volunteer — Association for the Support of Contemporary Living (Çağdaş Yaşamı Destekleme Derneği, ÇYDD)
Education.
Dec 2024 – present
Gönüllü — Kadın Emeğini Değerlendirme Vakfı (KEDV)
Sivil haklar ve toplumsal eylem.
Mayıs 2025 – günümüz
Gönüllü — Çağdaş Yaşamı Destekleme Derneği (ÇYDD)
Eğitim.
Aralık 2024 – günümüz
Research areasAraştırma alanları
Bioinformatics · biotechnology · molecular biology and genetics · genetics and heredity · biochemistry and molecular biology · evolutionary biology.
Biyoinformatik · biyoteknoloji · moleküler biyoloji ve genetik · genetik ve kalıtım · biyokimya ve moleküler biyoloji · evrimsel biyoloji.
Contactİletişim
AcademicAkademik tuna.birgun@yeniyuzyil.edu.tr
PersonalKişisel tunabirgun@gmail.com